Από τις πιο παλιές παλαιοντολογικές ανασκαφές που ξεκίνησαν στην Ελλάδα είναι αυτές στο Πικέρμι Αττικής. Τα απολιθώματα που έχουν βρεθεί στη θέση αυτή μετρούν χιλιάδες, με κάποια να κοσμούν και τις βιτρίνες διάσημων Μουσείων Φυσικής Ιστορίας του εξωτερικού.
Μερικές ακόμα πολύ σημαντικές ανασκαφικές θέσεις στην Ελλάδα αποτελούν η κοιλάδα του Αξιού, τα Γρεβενά, η Σάμος, το Σέσκλο και η Μεγαλόπολη.